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Illumina芯片服务平台

Illumina公司以测序业务闻名,而其在生物芯片方面的业务也具有不可忽视的优势和竞争力。 激光共聚焦微珠芯片技术是公司的核心技术之一,也是目前最前沿的芯片技术之一。

自2005年推出第一款芯片之后,Illumina不断创新经济,高通量及可扩展的芯片解决方案以满足日益增长的各种需求。结合了行业领先的芯片技术和infinium方法,我们全面的芯片系列产品提供极高的数据质量和极广的基因组覆盖度,从而加速靶向集合和全基因组研究。上海生工生物有限公司将为广大科研工作者提供基于Illumina Beadlab System的SNP基因分型和拷贝数变异(CNV)检测、DNA甲基化芯片和mRNA表达谱芯片等一系列生物芯片服务解决方案。

Illumina芯片技术特点:

 高重复性、高质量的数据,且单位样本成本低

 可支持快速、高通量和多重样本的处理

 提供专家精选、或者定制和半定制的形式

 可快速提供答案

Illumina芯片技术服务平台一览:

 

一、基因组层次研究服务: 

 Illumina human SNP分型芯片服务

芯片名称

芯片信息

Human omni-1 quad beadchip

此芯片数据来自于人类千人基因组计划测序结果。其中包含了超过114 万个探针信息,可以在一张芯片上平行进行4 个样本的检测。该款芯片包含针对基因SNPs、标签SNPs、拷贝数变化(CNV)及其他高价值的基因组区域设计探针。

Human omni express-12 beachip

含盖人类基因组计划HapMap三个阶段研究的数据,针对基因SNPs、标签SNPs、拷贝数变化(CNV)及其他高价值的基因组区域设计探针,共700,000多个位点,每张芯片可同时检测12个样本。

Human omni-zhonghua-8 beachip

此芯片是一款专为中国人设计的全基因组SNP基因分型芯片,每张芯片做8个样品,芯片覆盖了在中国人群体中发现的常有和稀有变异,适用于全基因组关联研究(GWAS)。经优化的90万个标签SNP信息来自HapMap所有三个阶段及千人基因组计划(1kGP),并经策略性选择,可用于在中国人种群中探索全新的疾病和性状关联。

Infinium Human Exome BeadChip

此芯片前所未有地覆盖了推定的功能性外显子变异,这些变异精选自12,000多个个体的外显子组和全基因组序列。外显子内容包含了> 240,000个标志物,它们代表了不同群体—包括欧洲、非洲、中国和西班牙个体—以及多种常见病,如II型糖尿病、癌症、代谢及精神疾病。

Cyto SNP-12 BeadChip

此芯片包含30万个和疾病相关的遗传标。数据来源于Hapmap  I和II

Omni2.5-Quad BeadChip

此芯片包含250万个SNP探针及CNV探针。用于基因分型和全基因组CNV分析,平均间隔1.2kb,MAF>2.5%。数据来源于Hapmap  I到III和1000 Genomes。

Omni5-Quad BeadChip

此芯片包含500万个SNP探针及CNV探针。用于基因分型和全基因组CNV分析,平均间隔0.6kb,MAF>1%。数据来源于Hapmap  I到III和1000 Genomes。

 Illumina 动物 SNP分型芯片服务

物种

芯片名称

芯片信息

Bovine HD BeadChip

Illumina公司与牛类研究专家联合开发出牛高密度SNP芯片,每个样本可检测777962个SNPs。

Ovine SNP50 BeadChip

该芯片由Illumina公司与国际羊基因组协会专家联合开发,它包含54241个SNP位点。平均每46kb有一个标记,覆盖整个基因组。

Equine SNP50 BeadChip

该芯片包含54602个SNP位点,这些位点均一分布在15个品种马匹的全基因组序列上,SNP的平均间隔为43.2kb。

Porcine SNP60 BeadChip

该芯片包含62163个SNP位点,覆盖猪的全基因组。此款芯片整合了多种猪的基因差异,包括杜洛克猪、长白猪,皮特兰猪和大白猪。

Canine HD BeadChip

该芯片包含超过17万个SNP位点,可以对任何一种家养犬类进行全基因组扫描。

 Illumina 植物 SNP分型芯片服务

物种

芯片名称

芯片信息

玉米

Maize SNP50 BeadChip

该芯片包含56,110个玉米SNP位点。

甘蓝

Intl Brassica SNP Consortium

该芯片包含52,157个甘蓝SNP位点。

樱桃

RosBREED Cherry

该芯片包含5,696个樱桃SNP位点。

RosBREED Peach

该芯片包含8,144个桃SNP位点。

大豆

BARCSoySNP6k

该芯片包含6,000个大豆SNP位点。

辣椒

UCD TraitGenetics Pepper (Capsicum) Consortium

该芯片包含20,000个辣椒SNP位点。

小麦

Private Wheat90k KSU

该芯片包含81,587个小麦SNP位点。

苹果

RosBREED Apple

该芯片包含8,788个苹果SNP位点。

苹果

Fruitbreedomics Apple20k

该芯片包含20,000 个苹果SNP位点。

葡萄

GrapeReSeq Consortium

该芯片包含18,071 个葡萄SNP位点。

燕麦

Oat Consortium

该芯片包含4,975 个燕麦SNP位点。

番茄

SolCAP Tomato 2013

该芯片包含7,720个番茄SNP位点。

小麦

US/Australia 9k Wheat Consortium

该芯片包含8,632个小麦SNP位点。

大麦

Barley Consortium 2013

该芯片包含7,864个大麦SNP位点。

马铃薯

Private WUR-STW Potato Consortium

该芯片包含17,987个马铃薯SNP位点。

马铃薯

SolCAP Potato 2013

该芯片包含8,303个马铃薯SNP位点。

向日葵

KWS-TraitGenetics Private Sunflower

该芯片包含30,000个向日葵SNP位点。

向日葵

Private Sunflower Consortium

该芯片包含10,640个向日葵SNP位点。

棉花

TAMU UCD Cotton Consortium

该芯片包含20,000个棉花SNP位点。

水稻

NSF_McCouch_Rice6k

该芯片包含6,000个水稻SNP位点。

豆类

USDA Common BeanCAP

该芯片包含5,398个SNP位点。

 定制SNP芯片服务:

Illumina提供两种定制SNP芯片检测技术:

GoldenGate Custom Panel –低中通量(48~3,072 SNP)

Infinium iSelect HD Custom Genotyping BeadChip-高通量(3,072~1,000,000 SNP)

二、转录组层次研究服务: 

 基因表达谱芯片服务

芯片型号

Human HT-12 v4 Expression BeadChip

Mouse WG-6 v2 Expression BeadChip

适应物种

人类

小鼠

产品规格

每张芯片可平行检测12个样本

每张芯片可平行检测6个样本

芯片介绍

每张芯片含有共约48,000个基因转录本,信息来源除36,000个NCBI RefSeq外,还包含了从UniGene的12,000个转录本信息。

每张芯片包含有约 45,281 个来自 MEMBO-RefSeq 及其补充序列,RIKEN补充序列的转录本信息。

三、表观遗传学研究服务

 Illumina DNA甲基化芯片

芯片型号

450K Infinium Methylation Bead Chip

适应物种

人类

产品规格

每张芯片可平行检测12个样本

芯片介绍

每个芯片可检测人基因组45万个甲基化位点,覆盖了所有的NCBI注释的基因,包括启动子,3’区和5’区。该芯片所检测的区域主要包括:CpG岛和CpG shores,CpG岛外的CpG位点,人干细胞中已经鉴定的非CpG的甲基化位点,已经鉴定的在不同类型的肿瘤中相对于其正常组织有差异的甲基化位点,编码区外的CpG岛,miRNA启动子区,通过GWAS研究已知的与疾病相关的区域等。

技术支持

电话:021-57072092
Email:service6@sangon.com

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